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Seules les espèces endémiques ont été retenues pour des questions méthodologiques car ces territoires ont une superficie trop petite pour pouvoir y appliquer la méthodologie de la Liste rouge à l’ensemble de leurs espèces. Pour ces îles, sur lesquelles pèsent généralement d’importantes menaces globales, évaluer l’ensemble des espèces reviendrait à toutes les classer dans les catégories les plus sévères de la méthodologie. En effet, la faible superficie de ces îles place leurs espèces directement en dessous des seuils du critère de répartition géographique restreinte pour les catégories « En danger critique » ou « En danger ». L’exercice ne remplirait alors plus son rôle de priorisation des espèces à enjeux. Pour les espèces endémiques, c’est-à-dire celles qui n’existent nulle part ailleurs dans le monde et qui relèvent donc de l’unique responsabilité de la France, la catégorisation ne change toutefois pas quelle que soit l’échelle d’évaluation – mondiale, supranationale ou nationale –, ce qui permet de les évaluer.

D’autres petits territoires ultramarins français n’ont pas pu être inclus dans le chapitre car ils ne possédaient pas d’espèces de plantes vasculaires endémiques.