La responsabilité française

Une espèce est dite endémique lorsqu’elle est présente exclusivement dans une région géographique délimitée. L‘aire de répartition limitée des espèces endémiques les place potentiellement parmi les premières espèces qui risquent d’être menacées d’extinction, c’est-à-dire de disparition totale. Les espèces endémiques du territoire français forment donc un patrimoine dont la France porte la responsabilité exclusive. Cet endémisme est nettement plus élevé dans les outre-mer insulaires : 22 % des espèces présentes y sont endémiques. Ce taux d’espèces endémiques est plus fort chez les espèces peu mobiles : il est par exemple beaucoup plus élevé pour les coléoptères que pour les papillons.

En 2019, il y avait 20 293 espèces endémiques et sub-endémiques connues en France (ultramarine et métropolitaine). Une espèce est dite subendémique lorsqu’elle se trouve uniquement dans un pays en particulier ou dans une zone très limitée d’un pays voisin.

 

Cormoran de Kerguelen (Leucocarbo verrucosus), endémique des îles Kerguelen ©Bruno MARIE - insularis@me.com

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Euprocte de Corse (Euproctus montanus), salamandre endémique de Corse ©Stanislas Wroza, OFB

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Elaboration d'un référentiel

Le taux d’extinction actuel des espèces dans le monde est des centaines de fois plus élevé que la moyenne des 10 derniers millions d’années : on parle de sixième extinction dans l’histoire de la planète. La précédente a eu lieu il y a 66 millions d’années et a entraîné, entre autres, la disparition des dinosaures. Jusqu’à un million d’espèces sont aujourd’hui menacées d’extinction.

L’Union internationale pour la conservation de la nature (UICN) a ainsi développé une méthode qui permet d’évaluer et de dresser un état des lieux du degré de menace pesant sur chaque espèce sauvage. Elle classe les espèces en 11 catégories :

Les espèces spécialistes particulièrement impactées

Une espèce est dite spécialiste quand elle nécessite un besoin particulier lors de tout ou partie de son cycle de vie (alimentation spécifique, habitat particulier, etc..). Le Flamant rose en est un exemple. Une espèce généraliste est capable d’exploiter des ressources variées et/ou relativement ubiquistes, donc est plus « polyvalente », comme le Lézard des murailles.
 

Lézard des murailles dans la Réserve naturelle de Mantet ©Elodie Klesczewski, OFB

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Flamants roses (Phoenicopterus roseus) en Occitanie ©Laure Corcelle, OFB

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Panicaut vivipare (Eryngium viviparum), en danger critique d’extinction (CR), plante rare et l'une des espèces les plus menacées en Europe, uniquement trouvable dans la commune de Belz, dans le Morbihan Charlotte Dissez / Conservatoire botanique national de Brest

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Les végétaux sont au cœur du fonctionnement des écosystèmes. Par le processus de la photosynthèse, ils sont à la base de toutes les chaînes alimentaires de la planète (à l’exception des écosystèmes très particuliers qui se développent au fond des océans autour des volcans sous-marins). En particulier, la flore entretient des relations étroites avec les pollinisateurs. Ils ont bien souvent co-évolué dans le temps. Si on veut préserver voire restaurer la biodiversité, les espèces d’origine locale doivent être prises en compte. Chaque habitat se caractérise par un ensemble plus ou moins spécifique de plusieurs espèces de la flore.

Les sociétés humaines dépendent de la flore car elle fournit de quoi se nourrir, se vêtir, s’abriter, se préserver de la chaleur et se soigner. À moyen ou long terme, l'érosion croissante de la diversité floristique affecte les écosystèmes et donc nécessairement l’alimentation et la santé humaines, ainsi que l’économie. À travers sa diversité et ses variations, la flore crée aussi l’identité et la variété des paysages.

La biodiversité bactérienne constitue un « continent caché » de la biodiversité. Les bactéries sont partout et remplissent des fonctions écologiques essentielles. Elles jouent un rôle dans les cycles biogéochimiques essentiels à la vie (oxygène, carbone, azote…). Elles peuvent aussi former des relations de symbiose avec d’autres organismes, comme certaines plantes (les bactéries aident les plantes à fixer l’azote et elles leur fournissent en retour du carbone) ou l’Homme (le tube digestif humain contient une "flore intestinale", c’est-à-dire un ensemble de bactéries qui aident notamment à la digestion et ont leur importance dans le développement du système immunitaire).

Escherichia coli, bactérie intestinale des mammifères

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La diversité bactérienne des sols peut être modifiée par les perturbations naturelles ou anthropiques. Elle varie en fonction du type de sol mais aussi du mode d’usage des sols (pratiques, contamination, etc.), avec des conséquences plus ou moins négatives sur le fonctionnement biologique du sol : fertilité biologique, barrière aux espèces invasives (pathogènes), renouvellement des matières organiques, changement climatique, etc.

Les forêts présentent des niveaux de diversité bactérienne des sols qui sont naturellement plus faibles puisque ces écosystèmes sont moins perturbés. Les milieux agricoles avec beaucoup d’interventions sur le sol sont plus perturbés et ont une richesse bactérienne plus élevée. Un niveau de diversité élevé ne renseigne cependant pas sur sa qualité (présence d’espèces bénéfiques d’intérêts ou au contraire néfastes comme les pathogènes par exemple). Dans une prairie permanente, les bactéries peuvent représenter jusqu’à plusieurs milliards d’individus (abondance) et 1 million d’espèces (diversité) par gramme de sol. Les variations liées aux conditions du milieu et l’impact des activités humaines sur cette abondance et cette diversité microbienne sont aujourd'hui mieux connues même si de nombreuses études restent nécessaires pour la comprendre.